20世纪60年代中期，日本率先开展了水稻品种抗稻瘟病基因分析的研究工作，鉴定了最初的8个抗性位点上的14个基因，并建立了一套抗稻瘟病基因分析用的鉴别体系（JDCs，Japanse differential cultivars），随后，国际水稻研究所和中国等产稻国也逐渐开展了水稻稻瘟病抗性遗传的系统性研究。截至2015年3月，已至少报道了69个抗稻瘟病位点共84个主效基因。这些基因成簇地分布于除第3 染色体外的所有水稻染色体上（2个隐性，其它显性），其中，Pb1, Pia, Pib, Pid2, Pid3, Pik, Pik-h/Pi54, Pik-m, Pik-p, Pish, Pit, Pita, Piz-t, Pi1, Pi2, Pi5, Pi9, pi21, Pi25, Pi36, Pi37, Pi56, Pi63, PiCO39 等24个基因已被成功克隆（Pi2、Pi9、Piz-t同为Piz 位点上的复等位基因；Pi1、Pik-h/Pi54、Pik-m、Pik-p同为Pik位点上的复等位基因；Pid3 与Pi25 等位；Pia 与PiCO39 等位）
为了本数据库平台更好地发展，如果您的工作参考了本网页清单的内容，请在文献中标明出处，如：
国家水稻数据中心. 稻瘟病主效抗性基因列表[DB/OL]. http://www.ricedata.cn/gene/gene_pi.htm, 2012-6-20.
需要注意的是：Sallaud 等利用QTL定位策略从高抗稻瘟品种IR64中定位了9个抗瘟性位点，分别命名为Pi24(t)~Pi32(t)，其中有5个位点未见前人报道。该工作属QTL初定位，故下表未将其列出...
已定位抗稻瘟病基因在水稻染色体组上分布情况（以粳稻品种日本晴测序图谱为基准）
截至2015年3月已定位的主效稻瘟抗性基因（已克隆；分染色体显示：1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 全部）
| Pi-a # |
B90002 |
Aichi Asahi |
11 |
|
| Pi-CO39 # |
6082 |
CO39 |
11 |
S2712(1.0cM) |
| Pi-b # |
BN209 |
IR24, BL1 |
2 |
C379～C2782B |
| Pi-f |
|
Chugoku 31-1 |
11 |
|
| Pi-hk1(t) |
北1 |
黑壳子粳 |
11 |
|
| Pi5/Pi3/Pi-i # |
PO6-6等 |
Tetep |
9 |
S04G03与C1454之间的170kb内 |
| Pi-k # |
PO6-6,Ca89等
|
Kusabue
|
11
|
R543(2.0cM) |
| Pi-1 # |
IK81-3,PO6-6等 |
LAC |
11 |
RZ536(7.9cM), Npb181(3.5cM) |
| Pik-h/Pi-54 # |
H05-56-1等 |
K3 |
11 |
RM224 ~ Y6855RA之间的2cM区间 |
| Pik-m # |
Ina 86-137等 |
Tsuyuake |
11 |
RM254 (13.4cM)～RM144 (1.2cM) |
| Pik-p # |
|
K60 |
11 |
|
| Pik-s |
|
|
11 |
|
| Pik-g(t) |
|
|
11 |
|
| Pi-sh # |
Kyu77-07A |
Shin-2 |
1 |
与pi-t 连锁 |
| Pi-t # |
V86010 |
K59 |
1 |
|
| Pi-ta # |
IK81-3,K81-25等
|
Pai-kan-tao等
|
12
|
RG241(5.2cM), RZ397(3.3cM) |
| Pi-ta2 |
|
|
12
|
|
| Pi-tan |
|
|
12
|
|
| Pi-z |
|
|
6 |
|
| Pi-2 # |
PO6-6等 |
Fukunishiki |
6 |
RG64(2.8cM)～R2123(2.7cM) |
| Pi-9 # |
PO6-6等 |
小粒野生稻 |
6 |
同上 |
| Piz-t # |
|
TKM.1 |
6 |
同上 |
| Pigm |
CH109(ZC13) |
谷梅4号 |
6 |
C5483 ~ C0428 之间的70kb 区间内 |
| Pi50 |
|
二八占 |
6 |
|
| Pi-d1(t) |
ZB13 |
地谷 |
2 |
G1314A(1.2cM), G45(10.6cM) |
| Pi-d2 # |
ZB15 |
地谷 |
6 |
RM527(3.2cM), RM3(3.4cM) |
| Pi-d3 # |
Zhong-10-8-14 |
地谷 |
6 |
|
| Pi-25 # |
92-183(ZC15) |
谷梅2号 |
6 |
A7(1.7cM), RG456(1.5cM) |
| Pi-6 |
/ |
Apura |
12 |
RG869-RG397 |
| Pi-7 |
/ |
Moroberekan |
11 |
RG103A- RG16 |
| Pi-8 |
日本小种007.0等 |
Kasalath |
6 |
与基因Amp-3 和Pgi-2 连锁 |
| Pi-10(t) |
菲律宾小种106 |
Tongil |
5 |
RRF6(3.8cM), RRH18(2.9cM) |
| Pi-11 |
中10-8-1, 研54-04 |
窄叶青8号 |
8 |
BP127A(14.9cM) |
| Pi-12(t) |
|
Moroberekan |
11 |
|
| Pi-13 |
/ |
Maowangu |
6 |
与基因Amp-3 连锁 |
| Pi-14 |
/ |
Maowangu |
2 |
与基因Amp-1 连锁 |
| Pi-15 |
CHL0416等 |
GA25 |
9 |
CRG5 ~ CRG2，与Pi3/Pi5 紧密连锁或等位 |
| Pi-16(t) |
TH67-22(031.5) |
Aus373 |
2 |
与基因Amp-1 连锁 |
| Pi-17(t) |
/ |
DJ123 |
7 |
与基因Est9 连锁 |
| Pi-18 |
KI-313 |
Suweon 365 |
11 |
RZ536(5.4cM) |
| Pi-19 |
CHNO58-3-1 |
Aichi Asahi |
12 |
跟Pi-ta2 紧密连锁或等位 |
| Pi-20 |
BN111 |
IR24 |
12 |
XNph88(1.0cM) |
| pi-21 # |
/ |
Owarihatamochi |
4 |
G271(5.0cM), G317(8.5cM) |
| Pi-21(t) |
KJ-101 |
Suweon 365 |
12 |
RG869 |
| Pi-22(t) |
KJ-201 |
Suweon 365 |
6 |
可能与Pi-2 等位 |
| Pi-23(t) |
|
Suweon 365 |
5 |
|
| Pi-24 |
92-183(ZC15) |
中156 |
12 |
RG241A(0cM) |
| Pi-26 |
Ca89 |
谷梅2号 |
6 |
B10(5.7cM), R674(25.8cM)，可能与Piz等位 |
| Pi-27(t) |
CHL0335等 |
Q14 |
1 |
RM151(12.1cM), RM259(9.8cM) |
| Pi-33 |
PH14, PH19等 |
IR64 |
8 |
Y2643L(0.9cM), RM72(0.7cM) |
| Pi-34 |
/ |
Chubu 32 |
11 |
C1172-C30038 |
| Pi-35(t) |
/ |
Hokkai 188 |
1 |
RM1216-RM1003 |
| Pi-36 # |
CHL39 |
Q61 |
8 |
RM5647-CRG2 |
| Pi-37 # |
CHL1405等 |
St. No. 1 |
1 |
RM543(0.7cM), RM319(1.6cM) |
| Pi-38 |
B157 |
Tadukan |
11 |
RM206,RM21 |
| Pi-39 |
CHL724 |
Q15 |
12 |
RM27933(0.09cM),RM27940(0.18cM) |
| Pi-40 |
韩国小种 |
澳洲野生稻 |
6 |
RM527(1.1cM), RM3330(2.4cM) |
| Pi-41 |
CHL1789, CHL347等 |
93-11 |
12 |
STS40-1 ~ STS40-3之间的800kb区间内 |
| Pi-42(t) |
DSN37-1 |
DHR9 |
12 |
RM2529 ~ RM1337, LOC_Os12g18374是候选基因 |
| Pi-42(t) |
美国小种IE-1k等 |
浙733 |
8 |
RM310 ~ RM72 |
| Pi-43(t) |
美国小种IE-1k等 |
浙733 |
11 |
RM1233 ~ RM224 |
| Pi-44(t) |
C9240-1等 |
Moroberekan |
11 |
AF349(3.3cM) |
| Pi-45(t) |
|
Moroberekan |
4 |
RM17499 ~ RM17511 |
| Pi-46(t) |
GD0193等 |
H4 |
11 |
RM224(1.04cM)~RM27360(1.2cM) |
| Pi-46(t) |
92-06-2等 |
Chumroo |
4 |
RM6748 ~ RM5473(3.2cM) |
| Pi-47(t) |
193-1-1等 |
Xiangzi 3150 |
11 |
RM206 ~ RM224 |
| Pi-48(t) |
193-1-1等 |
Xiangzi 3150 |
12 |
RM5364~RM7102 |
| pi-55(t) |
CHL688等 |
粤晶丝苗2号 |
8 |
RM1345-RM3452 |
| pi-56 # |
PO6-6等 |
三黄占2号 |
9 |
RM24022-RM24031 |
| Pi-62(t) |
|
Yashiro-mochi |
12 |
|
| Pi-63 # |
|
Kahei |
4 |
|
| Pi-157(t) |
|
Moroberekan |
12 |
|
| pb1 # |
/ |
Modan |
11 |
C189(1.2cM) |
| Pi-h-1(t) |
ZB1 |
红脚占 |
12 |
RG869(5.1cM) |
| Pi-tq1 |
IC-17, IB-49, IE-1 |
特青 |
6 |
C236-RG653 |
| Pi-tq5 |
IC-17, IB-49, IG-1, IE-1 |
特青 |
2 |
RG520-RZ446b，可能与Pi-b 等位 |
| Pi-tq6 |
IC-17, IB-49, IB-54, IE-1 |
特青 |
12 |
RG869-RZ397 |
| Pi-lm2 |
IB-54, IG-1 |
Lemont |
11 |
R4-RZ536 |
| Pi-GD-1(t) |
PO6-6 |
三黄占2号 |
8 |
XLRfr-8(3.6cM) |
| Pi-GD-2(t) |
PO6-6 |
三黄占2号 |
10 |
r16(3.9cM) |
| Pi-GD-3(t) |
PO6-6 |
三黄占2号 |
12 |
RM179(4.8cM) |
| Pi-g(t) |
Ken53-33 |
Guangchangzhan |
2 |
RM166(4.0cM), RM208(6.3cM) |
| Pi-y(t) |
四川-43菌系 |
云引 |
11 |
RM202(3.8cM) |
| Pi-zy(t) |
ZB13, ZE1 |
子预44 |
11 |
RM206(0cM) |
|
