·常规信息
基因(座)名称粒宽和粒厚调控基因; 具有去泛素化酶活性的otubain样蛋白酶; 去泛素化酶
wide and thick grain 1; otubain-like protease with deubiquitination activity; deubiquitinating enzyme
基因符号WTG1; OsOTUB1
所在染色体8 (已克隆)

WTG1(LOC_Os08g42540, Huang et al. 2017), OsOTUB1(LOC_Os08g42540, Wang et al. 2017), 位于同一基因位点...

WTG1是一个与人类OTUB1同源的otubain样蛋白酶,具有去泛素化酶活性。

【突变体表型】

wtg1-1突变体的粒宽、粒厚、千粒重以及主穗的穗粒数均增加,粒长变短,而过表达则会使水稻籽粒的粒宽及粒厚降低,粒长增加(Huang et al. 2017)。

下调OsOTUB1,能增强分生组织的活性,导致分蘖数减少,穗粒数和粒重增加,继而增加稻谷产量(Wang et al. 2017)。

【定位与克隆】

 

【时空表达谱】

WTG1在发育中的籽粒和穗中表达(Huang et al. 2017)。

【亚细胞定位】

细胞核和细胞质(Huang et al. 2017)

【生物学功能】

WTG1编码一个与人类中的OTUB1同源的Otubain-like蛋白酶,生化试验表明WTG1具有去泛素化酶活性,WTG1主要是通过影响颖壳细胞的扩展从而控制水稻籽粒的大小和形状(Huang et al. 2017)。

OsOTUB1与IPA1/OsSPL14互作,遗传上位于IPA1上游,有着共同的靶基因。OsOTUB1和OsSPL14的物理互作限制了OsSPL14的K63位多聚泛素化(K63Ub),反过来又促进OsSPL14的K48Ub依赖的蛋白酶体降解途径,OsOTUB1功能缺失使得OsSPL14大量积累,产生少分蘖、粗秆和大穗的株型(Wang et al. 2017)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP004464BAD01239, AP014964BAT06458
cDNAs及其产物:AK059388, BT129288
参考基因组位点:Os08g0537800(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os08g42540(本地MSU-RGAP←→ LOC4346169(NCBI)
参考基因组产物:XM_015794619XP_015650105
uniprot库登录号:B9G207
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征粒形(TO:0002730), 籽粒大小(TO:0000397), 每穗粒数(TO:0002759), 粒宽(TO:0000402), 粒长(TO:0000734), 粒厚(TO:0000399), 千粒重(TO:0000592), 植物细胞大小(TO:0002684)
分子功能蛋白酶活性(GO:0008233), 去泛素化酶活性(GO:0101005)
生物进程种子发育调控(GO:0080050), 细胞伸长调控(GO:0051510)
·参考文献
1Ke Huang;Dekai Wang;Penggen Duan;Baolan Zhang;Ran Xu;Na Li;Yunhai Li
  WIDE AND THICK GRAIN 1, which encodes an otubain-like protease with deubiquitination activity, influences grain size and shape in rice
  The Plant Journal, 2017, 91(5): 849-860
2Shuansuo Wang;Kun Wu;Qian Qian;Qian Liu;Qi Li;Yajun Pan;Yafeng Ye;Xueying Liu;Jing Wang;Jianqing Zhang;Shan Li;Yuejin Wu;Xiangdong Fu
  Non-canonical regulation of SPL transcription factors by a human OTUB1-like deubiquitinase defines a new plant type rice associated with higher grain yield
  Cell Research, 2017, 27: 1142-1156
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