·常规信息
基因(座)名称直立型密穗基因; 糖蛋白相关磷脂酶A
dense and erect panicle3; Patatin-related phospholipase A
基因符号DEP3; OspPLAIIIδ
所在染色体6 (已克隆)

DEP3(LOC_Os06g46350, Qiao et al. 2011), OspPLAIIIδ(Os06g46350, Liu et al. 2015), 位于同一基因位点...

【突变体表型】

dep3突变体的穗从开花到完全成熟都保持直立状态,而野生型植株的稻穗在花后就开始下垂,dep3的穗长、粒形以及每穗粒数等性状也发生了改变,解剖观察发现,与野生型相比,dep3在最上部的节间有更多的维管束,维管束更小、茎更粗(Qiao et al. 2011)。

【定位与克隆】

dep3突变体等位基因在LOC_Os06g46350处缺失408bp,包括第3外显子编码区的后47bp以及3'端的非翻译区的前361bp(Qiao et al. 2011)。

【生物学功能】

【相关登录号】
contigs及其产物:AP003728BAD45518, AP008212BAF20268, AP004989BAD45915
参考基因组位点:Os06g0677000(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os06g46350(本地MSU-RGAP
参考基因组产物:NM_001064889NP_001058354
uniprot库登录号:Q653V2
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征穗型(TO:0000089), 每穗实粒数(TO:0000447), 维管束数目(TO:0000472), 茎粗(TO:0000339)
分子功能磷脂酶活性(GO:0004620)
生物进程穗发育(GO:0010229)
·参考文献
1Guangmeng Liu;Ke Zhang;Jun Ai;Xianjun Deng;Yueyun Hong;Xuemin Wang
  Patatin-related phospholipase A, pPLAIIIα, modulates the longitudinal growth of vegetative tissues and seeds in rice
  Journal of Experimental Botany, 2015, 66(21): 6945-6955
2Yongli Qiao;Rihua Piao;Jinxia Shi;Song-I Lee;Wenzhu Jiang;Baek-Ki Kim;Joohyun Lee;Longzhi Han;Wenbo Ma;Hee-Jong Koh
  Fine mapping and candidate gene analysis of dense and erect panicle 3, DEP3, which confers high grain yield in rice (Oryza sativa L.)
  Theoretical and Applied Genetics, 2011, 122(7): 1439-1449
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