·常规信息
基因(座)名称白叶枯病抗性基因
Bacterial Blight resistance 1
基因符号Xa1
所在染色体4 (已克隆)
供体材料Kogyoku,Te-tep

Xa1(AB002266, Yoshimura et al. 1998), 来自籼稻, 可能对应日本晴参考基因组的LOC_Os04g53120(RGAP7.0)或Os04g0622600(build 5)...

与水稻白叶枯病抗性相关;鉴定所用菌株(小种):日本菌株X-17;属于NBS-LRR类基因。

【定位与克隆】

Xa1 cDNA编码5406 bp长的ORF,单拷贝,5', 3'端分别有112 bp和392 bp的非翻译区。Xa1含有4外显子,产物长1802氨基酸,该产物包含氨基端的核苷酸结合位点(NBS)和羧基端的富亮氨酸重复序列(LRR),无明显跨膜结构域,推测Xa1蛋白与病原菌无毒基因编码的配体的互作发生在胞质(Yoshimura et al. 1998)。

【时空表达谱】

接种细菌性病原体或遭受机械损伤,均能诱导抗病品种中Xa1的表达,而感病品种中检测不到表达(Yoshimura et al. 1998)。

【生物学功能】

Xa1 是一个NBS-LRR 类白叶枯病抗病基因,对日本的白叶枯病优势小种即小种1号具有专化性抗性。Xa1 的表达受非亲和及亲和小种诱导说明病原菌侵染造成的损伤可能诱导了Xa1 基因的表达,而Xa1 基因表达量的增加可能提高了Xa1 与无毒基因avr 互作的效率,从而激活了Xa1 介导了抗病信号传导通路,因此Xa1 在与病原菌的识别过程中发挥主要作用(Yoshimura et al., 1998)。

【备注】

据前人研究,Te-tep品种至少携带有Xa1, Xa2, Xa16三对抗白叶枯病基因,分别控制了对日本小种Ⅰ、Ⅱ和Ⅶ的抗性。

【相关登录号】
cDNAs及其产物:AB002266BAA25068
参考基因组位点:Os04g0622600(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os04g53120(本地MSU-RGAP←→ LOC4337041(NCBI)
uniprot库登录号:O48647
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征白叶枯病抗性(TO:0000175)
分子功能DNA结合(GO:0003677)
生物进程细胞凋亡(GO:0006915), 对细菌的防卫反应(GO:0042742), 机械损伤应答(GO:0009611)
形态构造维管叶(PO:0009025)
·参考文献
1Satomi Yoshimura;Utako Yamanouchi;Yuichi Katayose;Seiichi Toki;Zi-Xuan Wang;Izumi Kono;Nori Kurata;Masahiro Yano;Nobuo Iwata;and Takuji Sasaki
  Expression of Xa1, a bacterial blight-resistance gene in rice, is induced by bacterial inoculation
  Proceedings of the National Academy of Sciences, 1998, 95(4): 1663-1668
2S. Yoshimura;Y. Umehara;N. Kurata;Y. Nagamura;T. Sasaki;Y. Minobe;N. Iwata
  Identification of a YAC clone carrying the Xa-1 allele, a bacterial blight resistance gene in rice
  Theoretical and Applied Genetics, 1996, 93(1-2): 117-122
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